疾控中心和医院是两个系统,一般来说不能互相调动。但如果你在县级以上的地方工作,可以通过组织部门将你调到市里或省里面的疾病预防控制中心去;同样,你也可以从疾病预防控制中心借调到医院当医生(这就需要领导对你有所照顾了)。而且,在一些发达国家,疾病预防控制中心和医院都是分开的。但我们国家目前还没有做到这点,主要原因是经费问题。至于哪个好,那就看你自己怎么想了。
当然是疾控中心啊!毕竟他们接触的是社会最底层人群。现在全国各地的疾控中心基本都合并成卫生局了。